L'amore per gli animali spesso sfocia in odio per gli umani, questa caratteristica è utilizzata da Isaac, uno dei protagonisti, per dare vita alla sua vendetta. Vendetta che lo porterà a creare un vero e proprio impero grazie al quale riuscirà ad ottenere fama, soldi e potere. Le cose cambieranno drasticamente con l'incontro di Leonard, un seguace di Isaac che ammira molto ciò che ha fatto per gli animali. Il loro rapporto diventerà sempre più stretto, soprattutto dopo un evento spiacevole. Tra i due c'è anche Oliver, amico di Isaac da una vita, sempre preoccupato per le idee del suo amico.
I tre scaleranno la vetta fino a fondare un partito politico con così tanta influenza da non avere praticamente nessuna opposizione, creando una sorta di dittatura animalista dove la vita degli animali ha più valore di quella degli animali. Ma sono molte le modifiche, così tante che sia Isaac che Oliver non si rendono conto di ciò che hanno fatto se non anni dopo, capendo che ormai è Leonard il vero capo.
Leonard che non è però pienamente soddisfatto del suo operato, il mondo da lui sognato, nonostante sia a capo del partito ed abbia modificato la società come desiderava, stenta ad arrivare. Per questo motivo dà il via al piano denominato "Epurazione", che darà vita ad un mondo del tutto nuovo.
Ed è in questo mondo che appare un nuovo protagonista, Adam, un ragazzo che vive nel Nuovo Mondo già da bambino, essendo quindi ormai abituato a tutti i cambiamenti. La società è totalmente cambiata, non esistono più le città, o meglio, anche se le persone le chiamano ancora in questo modo, si tratta in realtà di villaggi con case di legno, se si ha fortuna. Questi villaggi sono strutturati con dei mestieri, ognuno ha un compito da portare a termine per sopravvivere. Uno di questi mestieri è l'Esploratore, ed è quello che Adam vuole fare, ormai raggiunta la maggiore età, affronterà la sua prima missione.
Gli Esploratori hanno un solo compito, visitare le rovine del Vecchio Mondo, ovvero le città ormai disabitate, in cerca di qualsiasi cosa possa essere utile. E' un lavoro rischioso perché le città sono spesso prese d'assedio dai "Bianchi", non si tratta di mostri o creature particolari, ma degli umani che hanno seguito la filosofia di Leonard ed il suo piano Epurazione. Questi sono individui che hanno totalmente abbandonato qualsiasi cosa sia stata creata dall'uomo, immergendosi nella natura. Per questo motivo, non indossano indumenti e non hanno armi, questo li renderebbe un bersaglio facile, ma la loro vita primitiva gli permette di comandare gli animali, anche quelli più pericolosi, senza problemi, diventando così una minaccia.
Ma è proprio durante la prima missione di Adam che il suo gruppo scopre una notizia che potrebbe cambiare per sempre la vita, abbastanza tranquilla, del suo villaggio. Sembra che i Bianchi si stiano unendo per distruggere una a una tutte le città del Nuovo Mondo, un comportamento fino ad ora mai visto. Cosa si cela dietro questa organizzazione? E perché i Bianchi si comportano come se attuassero delle strategie, cosa che secondo la loro filosofia non potrebbero fare?
Questi sono solo alcuni dei quesiti di questa seconda parte, dove appariranno nuovi volti, ma anche facce note, in un conflitto dove è in gioco la sopravvivenza della razza umana.